др Милана Грбић

Milan Predojević
 
др Милана Грбић
Доцент

Ужа научна област: Информационе науке и биоинформатика (развој софтвера)

Катедра: Катедра за рачунарске и информатичке науке

Контакт: milana.grbic@pmf.unibl.org

Кабинет: 29

Образовање:

  • Доктор наука – рачунарске науке, Математички факултет, Универзитет у Београду, 2020. године
  • Мастер математичар – Математички факултет, Универзитет у Београду, 2016. године
  • Дипломирани математичар и информатичар – Природно-математички факултет, Универзитет у Бањој Луци, 2012. године

Радни однос и звања:

  • 2020. – доцент
  • 2017.- 2020. – виши асистент
  • 2013. – 2017. – асистент

Настава

  • Основе програмирања 1/Увод у програмирање
  • Објектно оријентисано програмирање/Основе рачунарских система 1
  • Увод у истраживање података
  • Основе рачунарских система 2
  • Конструкција компилатора
  • Биоинформатика
  • Примјена мултимедија у образовању
  • Стручна пракса

Материјали за предмете су доступни кроз Гугл учионице. Консултације по договору са студентима, при чему је потребно јавити се на мејл 72 сата раније.

Наука

Радови у часописима са Web of Science, Scopus, SCIndex (M24 или M51), CPCI-S/CPCI-SSH листа:

  • Zec, T., & Grbić, M. (2023). Several Roman domination graph invariants on Kneser graphs. Discrete Mathematics & Theoretical Computer Science, 25(Graph Theory). (IF : 0.7)
  • Djukanović, M., Kartelj, A., Matić, D., Grbić, M., Blum, C., & Raidl, G. R. (2022). Graph search and variable neighborhood search for finding constrained longest common subsequences in artificial and real gene sequences. Applied Soft Computing, 122, 108844, (IF : 6.725)
  • Kartelj, A., Grbić, M., Matić, D., & Filipović, V. (2021). The Roman domination number of some special classes of graphs-convex polytopes. Applicable Analysis and Discrete Mathematics, 15(2), 393-412, (IF : 1.238)
  • Nikolic, B., Kartelj, A., Djukanovic, M., Grbic, M., Blum, C., & Raidl, G. (2021). Solving the Longest Common Subsequence Problem Concerning Non-Uniform Distributions of Letters in Input Strings. Mathematics, 9(13), 1515, (IF : 2.258)
  • Grbić, M., Matić, D., Kartelj, A., Vračević, S., and Filipović, V. (2020) A three-phase method for identifying functionally related protein groups in weighted PPI networks. Computational Biology and Chemistry, p.107246 (IF : 3.1)
  • Grbić, M., Kartelj, A., Janković, S., Matić, D., Filipović, V. (2020) Variable neighborhood search for partitioning sparse biological networks into the maximum edge-weighted k -plexes. IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics, DOI 10.1109/TCBB.2019.2898189. (IF: 4.5)
  • Grbić, M., Crnogorac, V., Predojević, M., Kartelj, A., & Matić, D. (2022). Supportness of the protein complex standards in PPI networks. Journal of Information and Telecommunication, 6(1), 6-26 (Q2: Computer Science (miscellaneous), Q3: Computer Science Application);

Радови у националним часописима прве категорије:

  • Predojević, M., Đukanović, M., Grbić, M., & Matić, D. (2021). Can greedy-like heuristics be useful for solving the Weighted Orthogonal Art Gallery Problem under regular grid discretization?. International Journal of Electrical Engineering and Computing, 5(2), 77-85.
  • Grbić, M. (2019) Conditional Random Fields-based Aproach to Classification: Application to Life Sciences, IPSI BgD Transactions on Internet Research (TIR), Special issue – „ICT Research at the University of Belgrade and at its Foreign Guests“, Vol. 15, No. 1, pp. 1-9, 2019, ISSN 1820 – 4511.
  • Grbić, M. (2019) A three-phase mapreduce-based algorithm for searching biomedical document databases, International Journal of Electrical Engineering and Computing, Vol 3, No.1, pp.1-8, 2019

Радови у националним часописима (друга и трећа категорија), зборницима и монографијама:

  • Jaguzović, M., Vilendečić, N., Grbić, M., & Matić, D. (2023). On similarity of PPI subnetworks induced by important proteins: A case study. In 2023 22nd International Symposium INFOTEH-JAHORINA (INFOTEH) (pp. 1-6). IEEE.
  • Jaguzović, M., Grbić, M., Ðukanović, M., & Matić, D. (2022) Identification of protein complexes by overlapping community detection algorithms: A comparative study. In 2022 21st International Symposium INFOTEH-JAHORINA (INFOTEH) (pp. 1-6). IEEE.
  • Zec, T., Kartelj, A., Djukanović, M., Grbić, M., & Matić, D. (2021). Statistical analysis of correlation between weather parameters and new COVID-19 cases: a case study of Bosnia and Herzegovina. In 2021 International Conference on INnovations in Intelligent SysTems and Applications (INISTA) (pp. 1-6). IEEE.
  • Crnogorac, V., Grbić, M., Đukanović, M., & Matić, D. (2021). Clustering of European countries and territories based on cumulative relative number of COVID 19 patients in 2020. In 2021 20th International Symposium INFOTEH-JAHORINA (INFOTEH) (pp. 1-6). IEEE.
  • Grbić, M., Crnogorac, V., Predojević, M., Kartelj, A., & Matić, D. (2020). How well are known protein complexes supported in PPI networks?. In 2020 International Conference on INnovations in Intelligent SysTems and Applications (INISTA) (pp. 1-7). IEEE.
  • Matić, D. and Grbić, M. (2020) Partitioning Weighted Metabolic Networks into Maximally Balanced Connected Partitions, 19th International Symposium INFOTEH-JAHORINA (INFOTEH), East Sarajevo, Bosnia and Herzegovina, 2020, pp. 1-6.

Међународне конференције:

  • Grbić М., “Analysis of classification algorithms applied to some prokaryotic organisms’’ (poster), Biocuration Conference, Ženeva, Švajcarska, 2016.
  • Grbić, M., Kartelj A., Matić D., Filipović V., “Partitioning biological networks in k-plex subnetworks with maximum edge weights’’ (poster), 3rd Symposium on Non-Globular Proteins, Košice, Slovačka, 2017.
  • Grbić, M., Kartelj A., Matić D., Filipović V., “A local search based heuristic for clustering large biological networks into highly connected components” (poster), First Congress of Molecular Biologists of Serbia, Beograd, Srbija, 2017.
  • Grbić, M., Janković, S., Matić, D., Pavlović-Lažetić, G., “Conditional Random Fields based approach for classification of the reactants in some metabolic reactions” (poster), Belgrade Bioinformatics Conference, Beograd, Srbija, 2018.
  • Matić D., Grbić M., Kartelj A., Janković, S., Filipović, V., “On clustering large biological networks into dense components” (poster), US-Serbia & West Balkan Data Science Workshop, Beograd, Srbija, 2018.
  • Grbić, M., Kartelj, A., Matić, D., Janković, S., Filipović, V., “A heuristic approach for clustering metabolic networks into highly connected components” (poster), 4th Symposium on Non-Globular Proteins, Druskininkai, Litvanija, 2018.
  • Grbić, M., B. Gemović, R. Davidović, A. Kartelj, D. Matić: “Prediction of GO terms for IDPs based on highly connected components in PPI networks”, Belgrade BioInformatics Conference 2021 (BELBI), virtuelna konferencija (poster).
  • Grbić, M., Matić D.: “On application of computational methods in network-based biological research” (poster), 80, 70, 20 Conference: Towards Excellence and Convergence Research in Theoretical Biology, Venecija, Italija, 2023.
  • Matić D., Grbić M.: “AI methods for biological networks and sequences”, 80, 70, 20 Conference: Towards Excellence and Convergence Research in Theoretical Biology, Venecija, Italija, 2023.
  • Grbić, M., Matić D.: “Local network properties of IDPs in PPIs network: Case study” (poster), 1st ML4NGP Meeting on Machine Learning and Non-Globular Proteins, Bratislava, Slovačka, 2023.
  • Grbić М., “Analysis of biological networks: Math, Computer Science, & Biology” (poster), ACM WomENcourage 2023, Trondhajm, Norveška, 2023.
  • Grbić М., Vilendečić, N., Predojević, M., Matić, D. “Collective Classification Algorithms in Identifying Intrinsically Disordered Proteins within Protein-Protein Interaction Networks” (poster & flash talk), 2nd MEETING on MACHINE LEARNING AND NON-GLOBULAR PROTEINS, Solun, Grčka, 2024.
  • Grbić М., Predojević, M., Vilendečić, N., Matić, D. “Exploration of Intrinsic Disorder Regions through Classification of Intrinsically Disordered Proteins Using PPI Network Structure and Sequence Attributes: A Case Study” (poster & flash talk), Belgrade Bioinformatics Conference – BelBi, Beograd, Srbija, 2024.

Пројекти:

Међународни пројекти:

  • COST ACTION: CA21160 – Non-globular proteins in the era of Machine Learning (ML4NGP) – (2022-2026) MC member for Bosnia and Herzegovina & co-lead WG3;
  • COST ACTION: CA21169 – Information, Coding, and Biological Function: the Dynamics of Life (DYNALIFE) – (2022-2026) MC member for Bosnia and Herzegovina & member of WG1, WG2, WG3;
  • COST ACTION: CA19122 – European Network For Gender Balance in Informatics (EUGAIN) – (2020-2024) MC member for Bosnia and Herzegovina & member of WG1;
  • COST ACTION: CA19135 – Connecting Education and Research Communities for an Innovative Resource Aware Society (CERCIRAS) – (2020-2024) member of WG4;
  • COST ACTION: BM1405 – Non-globular proteins – from sequence to structure, function and application in molecular physiopathology (NGP-NET) – (2016-2019) MC substitute member for Bosnia and Herzegovina;

Национални пројекти:

Координатор:

  • Анализа биолошких мрежа методама машинског учења (2024-2025); Финансијер: Министарство за научнотехнолошки развој и високо образовање Владе Републике Српске
  • Подршка реализацији COST акције CA21160 Non-globular proteins in the era of Machine Learning у Босни и Херцеговини (ML4NGPB&H) (2024); Финансијер: Министарство цивилних послова БиХ
  • Реализација COST ACTION: CA21160 – Non-globular proteins in the era of Machine Learning (2023); Финансијер: Министарство за научнотехнолошки развој и високо образовање Владе Републике Српске
  • Унапређење Алумни паметне интернет апликације за потребе повезивања бивших, тренутних и будућих студената математике и информатике Природно-математичког факултета Универзитета у Бањој Луци (2020); Финансијер: Министарство за научнотехнолошки развој, високо образовање и информационо друштво
  • Израда Алумни паметне интернет и мобилне апликације за потребе повезивања бивших, тренутних и будућих студената математике и информатике Природно-математичког факултета Универзитета у Бањој Луци (2019-2020); Финансијер: Министарство за научнотехнолошки развој, високо образовање и информационо друштво

Члан пројектног тима:

  • Тополошке и комбинаторне особине неких важних комплекса (2019-2023)
  • Развој и примјена метода комбинаторне оптимизације и метода машинског учења у биоинформатици (2019-2020)
  • Суфинансирање припремних активности за израду пројектног приједлога – COST акција (2020-2021)
  • Конфигурациони простори у дискретној геометрији (2020-2021)
  • Развој метода вјештачке интелигенције за рјешавање проблема рачунарске биологије (2020-2022)
  • Теоријски и алгоритамски аспекти за рјешавање проблема римске доминације (2023-2024)
  • Реализација COST акције Information, Coding, and Biological Function: The Dynamics of Life (2023-2024)
  • Развој модела и алгоритама вјештачке интелигенције за рјешавање тешких проблема комбинаторне оптимизације (2024-2025)
  • Подршка за учешће истраживачког тима Босне и Херцеговине у COST акцији CA21169: Information, Coding, and Biological Function: the Dynamics of Life (2024)

Зимске и љетње школе & студијски боравци & Erasmus +:

  1. NGP-net Winter School on Experimental Methods for Protein Disorder & Aggregation, Marseille, France, February 2017.
  2. NGP-NET Winter School on Computational Methods for Non-globular Proteins, Nicosia, Cyprus, January 2018.
  3. Студијски боравак у Лабораторији за биоинформатику и рачунарску хемију, Институт за нуклеарне науке Винча, Универзитет у Београду. Тема посете: „Предиктор за функционалну анаотацију унутрашње неуређених протеина“, February 2019. STSM подржан кроз COST акцију BM1405.
  4. ICGEB Course „Bioinformatics: Computer Methods in Molecular and Systems Biology“, Trieste, Italy, June 2019.
  5. Staff Mobility for Training at Carinthia University of Applied Sciences, Villach, Austria, December 2019.
  6. Staff Training Week, University of Granada, Spain, May 16-20, 2022.
  7. EUGAIN Workshops, Hamburg, Germany, October 2022.
  8. 1ST ML4NGP TRAINING SCHOOL, Protein Aggregation, Intrinsic Disorder and Phase Separation in the Era of Machine Learning, Porto, Portugal, April 2023.
  9. Staff Mobility for Teaching at Carinthia University of Applied Sciences, Villach, Austria, April 2023.
  10. 2nd International EUGAIN Summer Training School: Research Recharge, Rome, Italy, June 2023.
  11. Final EUGAIN Conference and MC Meeting, Lisbon, Portugal, April 2024.

Објављени уџбеници

  1. Боја Николић, Борис Петковић, Марко Ђукановић, Милана Грбић и Татјана Зец, Збирка урађених задатака са пријемних испита из математике, Природно-математички факултет, Универзитет у Бањој Луци, 2016.
  2. Милана Грбић, Драган Матић, Увод у објектно оријентисано програмирање кроз програмски језик Јава, Природно-математички факултет, Универзитет у Бањој Луци, 2023.

Остало

Награде:

  • 2021. Математички институт САНУ (Српска академија наука и уметности) Београд за најбољи докторат у области рачунарства који је одбрањен 2020. године.

Рецензије:

  • Рецензент радова кандидата за часопис Journal of Big Data, 2022.
  • Рецензент радова кандидата за часопис Engineering Applications of Artificial Intelligence, 2023.
  • Рецензент радова кандидата за часопис „Мат-Кол“
  • Рецензент радова за међународни симпозијум ИНФОТЕХ-ЈАХОРИНА 2024.

Чланства у организацијама:

  • ISB International Society for Biocuration (од 2016. године)
  • Српско друштво за биоинформатику и рачунарску биологију (од 2018. године)

Обуке:

  • COST Academy Leadership workshop, 8. септембар 2022., Брисел, Белгија

Линкови: